Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGRMC1O00264 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGRMC1O00264 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms