Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGRPO00253 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGRPO00253 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGRPO00253 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGRPO00253 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGRPO00253 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGRPO00253 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGRPO00253 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGRPO00253 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGRPO00253 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGRPO00253 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGRPO00253 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGRPO00253 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGRPO00253 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGRPO00253 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGRPO00253 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGRPO00253 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGRPO00253 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGRPO00253 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGRPO00253 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGRPO00253 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGRPO00253 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGRPO00253 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGRPO00253 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGRPO00253 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGRPO00253 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGRPO00253 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms