Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR4O00206 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR4O00206 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR4O00206 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLR4O00206 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR4O00206 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR4O00206 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR4O00206 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLR4O00206 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLR4O00206 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR4O00206 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR4O00206 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLR4O00206 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLR4O00206 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR4O00206 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLR4O00206 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR4O00206 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLR4O00206 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLR4O00206 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR4O00206 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR4O00206 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR4O00206 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLR4O00206 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLR4O00206 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLR4O00206 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLR4O00206 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR4O00206 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLR4O00206 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLR4O00206 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms