Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STX16-NPEPL1H3BU86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms