Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B2RBV5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B2RBV5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B2RBV5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B2RBV5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B2RBV5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B2RBV5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B2RBV5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B2RBV5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B2RBV5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B2RBV5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B2RBV5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B2RBV5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
B2RBV5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B2RBV5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms