Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NOTOA8MTQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NOTOA8MTQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 515.9 ms