Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM49BA6NDI0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms