Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNDIG1LA6NDD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms