Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPDC1A2A3K4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPDC1A2A3K4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms