Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD3A2A2Y4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms