Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRGMA1A4Y4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRGMA1A4Y4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms