Protein–RNA interactions for Protein: A1A4V9

CCDC189, Coiled-coil domain-containing protein 189, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189A1A4V9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC189A1A4V9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC189A1A4V9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC189A1A4V9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC189A1A4V9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC189A1A4V9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms