Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S1A1TA0A578 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCRBV5S1A1TA0A578 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S1A1TA0A578 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms