Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms