Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A0D9SFI3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A0D9SFI3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A0D9SFI3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms