Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYD5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0A6YYD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A0A6YYD5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A0A6YYD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0A6YYD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms