Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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COPS3Q9UNS2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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