Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRPF3Q9ULD4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms