Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD1Q9UIS9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms