Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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