Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC3IPQ9P2W1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms