Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REREQ9P2R6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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