Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HCN3Q9P1Z3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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