Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms