Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms