Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms