Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms