Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHST12Q9NRB3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms