Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLCO1B3Q9NPD5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms