Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PARD6AQ9NPB6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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