Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRHQ9HD43 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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