Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms