Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms