Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms