Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms