Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms