Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2AFJQ9BTM1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2AFJQ9BTM1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms