Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCF12Q99081 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms