Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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C2orf48Q96LS8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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