Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C18orf8Q96DM3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms