Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCE1Q969G3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCE1Q969G3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms