Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TOPBP1Q92547 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TOPBP1Q92547 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms