Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SRSF12Q8WXF0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms