Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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