Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLF2Q8IX21 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms