Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms