Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms