Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OTOP1Q7RTM1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTOP1Q7RTM1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms