Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms