Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C16orf54Q6UWD8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms